Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms