Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms