Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms