Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms