Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms