Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUSC1Q9BVN2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUSC1Q9BVN2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms