Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms