Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms