Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms