Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms