Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms