Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD6Q96NE9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms