Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms