Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGBD4Q96DM1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms