Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms