Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms