Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms