Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C17orf47Q8NEP4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C17orf47Q8NEP4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms