Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

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Length 1,253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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VWA5B2Q8N398 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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VWA5B2Q8N398 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms