Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWU2

LMTK2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK2Q8IWU2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMTK2Q8IWU2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms