Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX32Q86XE0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX32Q86XE0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms