Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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