Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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