Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms