Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms