Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSTM1Q6UX27 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSTM1Q6UX27 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms