Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms