Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms