Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HES3Q5TGS1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms