Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms