Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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