Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms