Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms