Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ODF3L2Q3SX64 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms