Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMU1Q2TAY7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms