Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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