Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms