Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CNGA3Q16281 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CNGA3Q16281 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CNGA3Q16281 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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