Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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