Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms