Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF2Q15853 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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