Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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EFNB3Q15768 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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EFNB3Q15768 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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