Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
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