Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HNF4GQ14541 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HNF4GQ14541 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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