Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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