Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms