Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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