Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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