Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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ITGA7Q13683 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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ITGA7Q13683 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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ITGA7Q13683 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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ITGA7Q13683 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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ITGA7Q13683 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA7Q13683 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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