Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA5AQ13591 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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